Для дистанційної форми навчання в школі повинна бути підготовлена наукова – методична база, робочі навчальні плани із годинами на дистанційні курси та факультативи, проведена велика підготовча та організаційна робота. Як в кожній новій справі на шляху впровадження ДН в загальноосвітніх закладах є багато труднощів:

• відсутність досвіду роботи в даному напрямку;
• відсутність достатньої нормативно-правої та науково-методичної бази;
• необхідність психологічної підготовки всіх учасників навчально-виховного процесу до запровадження та використання такої інновації;
• невизначеність чітких розмежувань розподілу навчального часу на очне та дистанційне навчання;
• відсутність системи підготовки педагогів-предметників до використання та запровадження дистанційного навчання в школі;
• недостатнє забезпечення технічними засобами як школи так і учнів;

• недостатній рівень володіння комп’ютерною технікою, навичками роботи в Інтернеті, використання інтерактивних технологій навчання;
• не сформованість навичок самоосвіти, саморозвитку, саморегуляції, професійної рефлексії;
• складність у розробці навчальних програм, підручників, посібників, недостатня варіативність;